Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF212Q495C1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms