Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SCARB2Q14108 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SCARB2Q14108 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
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