Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ECH1Q13011 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ECH1Q13011 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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