Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SP4Q02446 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SP4Q02446 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SP4Q02446 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP4Q02446 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP4Q02446 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP4Q02446 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP4Q02446 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP4Q02446 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SP4Q02446 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SP4Q02446 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SP4Q02446 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SP4Q02446 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SP4Q02446 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SP4Q02446 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SP4Q02446 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms