Protein–RNA interactions for Protein: P62873

GNB1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB1P62873 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GNB1P62873 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNB1P62873 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GNB1P62873 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GNB1P62873 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GNB1P62873 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GNB1P62873 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GNB1P62873 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
GNB1P62873 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GNB1P62873 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GNB1P62873 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms