Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SSR1P43307 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SSR1P43307 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SSR1P43307 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SSR1P43307 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSR1P43307 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SSR1P43307 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SSR1P43307 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms