Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP5F1P24539 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5F1P24539 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms