Protein–RNA interactions for Protein: P16383

GCFC2, GC-rich sequence DNA-binding factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCFC2P16383 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GCFC2P16383 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GCFC2P16383 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms