Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LINC00032P0C843 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LINC00032P0C843 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms