Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B9

SUPT16H, FACT complex subunit SPT16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT16HQ9Y5B9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SUPT16HQ9Y5B9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SUPT16HQ9Y5B9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms