Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SNX15Q9NRS6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SNX15Q9NRS6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms