Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-216ENST00000529601 1671 ntTSL 231.75■■■□□ 2.679e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.666e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-223ENST00000533646 486 ntTSL 231.43■■■□□ 2.629e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.566e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 230.78■■■□□ 2.526e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-224ENST00000533766 1547 ntTSL 530.75■■■□□ 2.519e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.489e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-203ENST00000593804 1586 ntTSL 230.53■■■□□ 2.486e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-206ENST00000598090 463 ntTSL 330.52■■■□□ 2.486e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-218ENST00000530750 365 ntTSL 530.4■■■□□ 2.469e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-221ENST00000531321 945 ntTSL 330.27■■■□□ 2.449e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-214ENST00000529292 1305 ntTSL 530.26■■■□□ 2.439e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SCARF1-204ENST00000570902 1060 ntTSL 1 (best)30.25■■■□□ 2.436e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TCF12-210ENST00000558908 553 ntTSL 430.03■■■□□ 2.46e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TCF12-215ENST00000560190 1183 ntTSL 1 (best)30.03■■■□□ 2.46e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-204ENST00000524986 729 ntTSL 329.9■■■□□ 2.389e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.366e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-205ENST00000525385 1014 ntTSL 529.66■■■□□ 2.349e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-211ENST00000528026 582 ntTSL 329.66■■■□□ 2.349e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 RPS28-202ENST00000449223 1523 ntTSL 229.52■■■□□ 2.326e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 429.42■■■□□ 2.36e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SLCO5A1-204ENST00000526750 2650 ntTSL 529.42■■■□□ 2.36e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-203ENST00000524690 843 ntTSL 529.29■■■□□ 2.289e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-208ENST00000526809 829 ntTSL 529.29■■■□□ 2.289e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.266e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-225ENST00000534371 913 ntTSL 529.08■■■□□ 2.259e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-211ENST00000601135 723 ntTSL 228.03■■■□□ 2.086e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SCARF1-206ENST00000573852 2698 ntTSL 1 (best)27.2■■□□□ 1.956e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-202ENST00000593561 546 ntTSL 426.47■■□□□ 1.836e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-207ENST00000598200 465 ntTSL 326.31■■□□□ 1.86e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 DEDD2-213ENST00000602201 556 ntTSL 426.26■■□□□ 1.796e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.766e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TM7SF2-207ENST00000526085 570 ntTSL 525.51■■□□□ 1.679e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.566e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.536e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.486e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.376e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 RPS28-201ENST00000417088 334 ntTSL 223.35■■□□□ 1.336e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SS18L1-205ENST00000492466 899 ntTSL 522.85■■□□□ 1.256e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SCARF1-203ENST00000434376 3342 ntTSL 1 (best)21.52■■□□□ 1.046e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.986e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.966e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.936e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 RPS28-204ENST00000602140 912 ntTSL 1 (best)20.67■□□□□ 0.96e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SCARF1-209ENST00000576012 3292 ntTSL 219.33■□□□□ 0.686e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TBCD-224ENST00000576760 1059 ntTSL 519.19■□□□□ 0.666e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TCF12-212ENST00000559609 2252 ntTSL 218.82■□□□□ 0.66e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.566e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TBCD-210ENST00000572953 702 ntTSL 517.42■□□□□ 0.386e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TBCD-213ENST00000574422 879 ntTSL 217.31■□□□□ 0.366e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.336e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TBCD-205ENST00000571618 775 ntTSL 317.04■□□□□ 0.326e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TCF12-201ENST00000267811 6061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.176e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TBCD-217ENST00000574975 867 ntTSL 516.01■□□□□ 0.156e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TCF12-202ENST00000333725 4719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.066e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TCF12-204ENST00000438423 4786 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.016e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 BANF1-206ENST00000528648 362 ntTSL 315.06■□□□□ 06e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 HMGB3-201ENST00000325307 3560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 06e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TCF12-207ENST00000557843 4076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.856e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 HMGB3-202ENST00000419110 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 39.06□□□□□ -0.966e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 THOP1-209ENST00000589087 2977 ntTSL 224.77■■□□□ 1.562e-11■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 COQ8A-207ENST00000485462 2141 ntTSL 1 (best)22.97■■□□□ 1.274e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SLC4A2-218ENST00000494125 782 ntTSL 237.26■■■■□ 3.552e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SLC4A2-213ENST00000483786 571 ntTSL 426.46■■□□□ 1.832e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.922e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.732e-8■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.852e-7■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.749e-7■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 ATF6B-216ENST00000494022 320 ntTSL 219.4■□□□□ 0.79e-7■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.519e-7■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-216ENST00000589956 594 ntTSL 527.68■■■□□ 2.022e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-208ENST00000587654 575 ntTSL 425.16■■□□□ 1.622e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-205ENST00000586775 945 ntTSL 324■■□□□ 1.432e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-204ENST00000585886 2362 ntTSL 1 (best)23.49■■□□□ 1.352e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.182e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-214ENST00000589337 541 ntTSL 418.96■□□□□ 0.632e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.462e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.432e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-210ENST00000588216 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 TNPO2-217ENST00000590781 547 ntTSL 413.67□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 220.18■□□□□ 0.822e-6■■■■□ 21.9
DROSHAQ9NRR4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.62e-6■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.362e-6■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 522.05■■□□□ 1.122e-6■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.687e-7■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ANO9-206ENST00000528927 2639 ntTSL 1 (best)23.06■■□□□ 1.284e-9■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ANO9-207ENST00000532094 5487 ntTSL 220.54■□□□□ 0.884e-9■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.84e-9■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.833e-11■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.323e-11■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.763e-11■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ELOC-203ENST00000519082 634 ntTSL 221.73■■□□□ 1.073e-11■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ELOC-205ENST00000520210 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.093e-11■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ELOC-202ENST00000518127 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-11■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.663e-11■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 MAP3K7-204ENST00000369329 4911 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-6■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.141e-6■■■■□ 21.8
DROSHAQ9NRR4 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.221e-6■■■■□ 21.8
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