Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
UPF2Q9HAU5 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
UPF2Q9HAU5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
UPF2Q9HAU5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms