Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRACR2AQ9BSW2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRACR2AQ9BSW2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms