Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CITED4Q96RK1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CITED4Q96RK1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms