Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB72

PUM2, Pumilio homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM2Q8TB72 FAM208B-203ENST00000459693 1841 ntTSL 1 (best)5.11□□□□□ -1.592e-6■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 SMIM29-208ENST00000495581 911 ntTSL 219.45■□□□□ 0.71e-6■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ZMYM2-202ENST00000382871 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.268e-16■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.388e-16■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ZMYM2-205ENST00000382883 5445 ntTSL 53.81□□□□□ -1.88e-16■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.968e-16■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ZMYM2-201ENST00000382870 3456 ntTSL 1 (best)1.98□□□□□ -2.098e-16■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.354e-35■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 CD81-216ENST00000531840 5235 ntTSL 1 (best)16.83■□□□□ 0.294e-35■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 CD81-204ENST00000468153 940 ntTSL 216.71■□□□□ 0.274e-35■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 CD81-206ENST00000481386 898 ntTSL 216.71■□□□□ 0.274e-35■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.124e-35■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.294e-35■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.098e-9■■■■■ 33.6
PUM2Q8TB72 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.886e-6■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.866e-6■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 RNF4-210ENST00000508235 603 ntTSL 313.97□□□□□ -0.176e-6■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.118e-18■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 UGGT1-202ENST00000376723 6682 ntTSL 1 (best)14.96□□□□□ -0.013e-6■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.018e-18■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MMS19-218ENST00000485400 1513 ntTSL 214.36□□□□□ -0.112e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MMS19-212ENST00000444411 640 ntTSL 213.61□□□□□ -0.232e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.272e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 CNOT8-219ENST00000521729 1068 ntTSL 213.34□□□□□ -0.278e-18■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 AAR2-203ENST00000397286 1466 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.332e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.382e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MMS19-219ENST00000495415 1879 ntTSL 512.21□□□□□ -0.462e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.522e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MMS19-207ENST00000434538 2164 ntTSL 211.31□□□□□ -0.62e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 C1orf131-201ENST00000318906 2483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MMS19-204ENST00000415383 3401 ntTSL 1 (best)10.85□□□□□ -0.672e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MMS19-201ENST00000327238 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.722e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MMS19-203ENST00000370782 3532 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 C1orf131-202ENST00000366649 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.732e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MMS19-209ENST00000438925 3797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.782e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.81e-13■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MMS19-202ENST00000355839 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.852e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 UGGT1-203ENST00000418197 599 ntTSL 58.81□□□□□ -13e-6■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 GOLGA1-204ENST00000475407 4107 ntTSL 57.67□□□□□ -1.182e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 C1orf131-203ENST00000366651 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.242e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 UGGT1-206ENST00000465836 517 ntTSL 26.89□□□□□ -1.313e-6■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MYCBP2-212ENST00000612956 1542 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.362e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.473e-6■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 MYCBP2-202ENST00000429715 3660 ntTSL 24.93□□□□□ -1.622e-9■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.658e-15■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 IRGQ-202ENST00000596409 3752 nt5.32□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.836e-8■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.486e-8■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.326e-8■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 ATP6V1A-202ENST00000461496 542 ntTSL 58.41□□□□□ -1.065e-58■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 GLE1-201ENST00000309971 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.976e-16■■■■■ 33.5
PUM2Q8TB72 WDR82-201ENST00000296490 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.614e-8■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.868e-7■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.338e-7■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 SMIM29-204ENST00000463083 1487 ntTSL 217.02■□□□□ 0.328e-7■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 SMIM29-210ENST00000637920 1093 ntTSL 216.98■□□□□ 0.318e-7■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.138e-7■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 SMIM29-203ENST00000413013 806 ntTSL 215.69■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.836e-7■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.44e-8■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.813e-6■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.343e-6■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.461e-8■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.394e-10■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.664e-10■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 E2F8-202ENST00000527884 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.691e-6■■■■■ 33.4
PUM2Q8TB72 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.154e-9■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.614e-9■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.124e-9■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.281e-7■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SPG21-213ENST00000561078 1520 ntTSL 514.09□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SPG21-209ENST00000559199 2059 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 ZFP36-202ENST00000594442 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.93■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SBF1-205ENST00000470434 2139 ntTSL 518.17■□□□□ 0.51e-6■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SBF1-204ENST00000418590 1578 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.031e-6■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.241e-6■■■■■ 33.3
PUM2Q8TB72 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.662e-11■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.099e-10■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 PRPF8-207ENST00000573681 1044 ntTSL 212.34□□□□□ -0.437e-13■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 PRPF8-209ENST00000573725 749 ntTSL 56.07□□□□□ -1.447e-13■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.663e-15■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 SMAP2-202ENST00000372718 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)16.98■□□□□ 0.317e-36■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.867e-36■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)9.33□□□□□ -0.927e-36■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.987e-36■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 DENND4A-203ENST00000561863 480 ntTSL 28.1□□□□□ -1.111e-7■■■■■ 33.2
PUM2Q8TB72 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.581e-7■■■■■ 33.2
Retrieved 100 of 17,637 protein–RNA pairs in 215.6 ms