RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594442.1

ZFP36-202, Transcript of ZFP36 ring finger protein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene ZFP36, Length 1,699 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFP36-202ENST00000594442 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.47■■■■■ 4.55
ZFP36-202ENST00000594442 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.5■■■■□ 3.75
ZFP36-202ENST00000594442 ABCC9O60706 1549 aa37.4■■■■□ 3.58
ZFP36-202ENST00000594442 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.28■■■■□ 3.4
ZFP36-202ENST00000594442 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.19■■■■□ 3.38
ZFP36-202ENST00000594442 NACADO15069 1562 aa36.1■■■■□ 3.37
ZFP36-202ENST00000594442 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.07■■■■□ 3.37
ZFP36-202ENST00000594442 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.98■■■■□ 3.35
ZFP36-202ENST00000594442 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.94■■■■□ 3.34
ZFP36-202ENST00000594442 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.37■■■■□ 3.25
ZFP36-202ENST00000594442 SCRIBQ14160 1630 aa35.2■■■■□ 3.22
ZFP36-202ENST00000594442 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.03■■■■□ 3.2
ZFP36-202ENST00000594442 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35■■■■□ 3.19
ZFP36-202ENST00000594442 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.58■■■■□ 3.13
ZFP36-202ENST00000594442 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.07■■■■□ 3.04
ZFP36-202ENST00000594442 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.06■■■■□ 3.04
ZFP36-202ENST00000594442 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.87■■■■□ 3.01
ZFP36-202ENST00000594442 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.85■■■■□ 3.01
ZFP36-202ENST00000594442 SMARCA4P51532 1647 aa33.68■■■□□ 2.98
ZFP36-202ENST00000594442 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.66■■■□□ 2.98
ZFP36-202ENST00000594442 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.53■■■□□ 2.96
ZFP36-202ENST00000594442 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.4■■■□□ 2.94
ZFP36-202ENST00000594442 SMARCA2P51531 1590 aa33.35■■■□□ 2.93
ZFP36-202ENST00000594442 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.33■■■□□ 2.93
ZFP36-202ENST00000594442 NCAPD3P42695 1498 aa33.31■■■□□ 2.92
ZFP36-202ENST00000594442 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.24■■■□□ 2.91
ZFP36-202ENST00000594442 WIZO95785 1651 aa33.21■■■□□ 2.91
ZFP36-202ENST00000594442 HMGXB3Q12766 1538 aa33.19■■■□□ 2.9
ZFP36-202ENST00000594442 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.14■■■□□ 2.9
ZFP36-202ENST00000594442 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
ZFP36-202ENST00000594442 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP32.64■■■□□ 2.82
ZFP36-202ENST00000594442 NESP48681 1621 aa32.48■■■□□ 2.79
ZFP36-202ENST00000594442 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.45■■■□□ 2.79
ZFP36-202ENST00000594442 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.39■■■□□ 2.78
ZFP36-202ENST00000594442 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.36■■■□□ 2.77
ZFP36-202ENST00000594442 CFTRP13569 1480 aa32.25■■■□□ 2.75
ZFP36-202ENST00000594442 ERCC6Q03468 1493 aa32.17■■■□□ 2.74
ZFP36-202ENST00000594442 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.13■■■□□ 2.73
ZFP36-202ENST00000594442 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.12■■■□□ 2.73
ZFP36-202ENST00000594442 PRDM2Q13029 1718 aa32.08■■■□□ 2.73
ZFP36-202ENST00000594442 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32■■■□□ 2.71
ZFP36-202ENST00000594442 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.93■■■□□ 2.7
ZFP36-202ENST00000594442 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.91■■■□□ 2.7
ZFP36-202ENST00000594442 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.81■■■□□ 2.68
ZFP36-202ENST00000594442 WDR62O43379 1518 aa31.71■■■□□ 2.67
ZFP36-202ENST00000594442 CUX2O14529 1486 aa31.7■■■□□ 2.67
ZFP36-202ENST00000594442 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
ZFP36-202ENST00000594442 TOPBP1Q92547 1522 aa31.54■■■□□ 2.64
ZFP36-202ENST00000594442 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.52■■■□□ 2.64
ZFP36-202ENST00000594442 ABCC8Q09428 1581 aa31.49■■■□□ 2.63
ZFP36-202ENST00000594442 CUX1P39880 1505 aa31.44■■■□□ 2.62
ZFP36-202ENST00000594442 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.32■■■□□ 2.6
ZFP36-202ENST00000594442 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.3■■■□□ 2.6
ZFP36-202ENST00000594442 SYNJ1O43426 1573 aa31.27■■■□□ 2.6
ZFP36-202ENST00000594442 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.27■■■□□ 2.6
ZFP36-202ENST00000594442 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.24■■■□□ 2.59
ZFP36-202ENST00000594442 TOP2BQ02880 1626 aa31.24■■■□□ 2.59
ZFP36-202ENST00000594442 IFT140Q96RY7 1462 aa31.23■■■□□ 2.59
ZFP36-202ENST00000594442 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.19■■■□□ 2.58
ZFP36-202ENST00000594442 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.18■■■□□ 2.58
ZFP36-202ENST00000594442 SOGA1O94964 1423 aa31.15■■■□□ 2.58
ZFP36-202ENST00000594442 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
ZFP36-202ENST00000594442 WDR97A6NE52 1622 aa31.03■■■□□ 2.56
ZFP36-202ENST00000594442 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
ZFP36-202ENST00000594442 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.97■■■□□ 2.558e-9■■■■■ 27.3
ZFP36-202ENST00000594442 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.96■■■□□ 2.55
ZFP36-202ENST00000594442 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
ZFP36-202ENST00000594442 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.84■■■□□ 2.53
ZFP36-202ENST00000594442 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.81■■■□□ 2.52
ZFP36-202ENST00000594442 TRIM41Q8WV44 630 aa30.78■■■□□ 2.52
ZFP36-202ENST00000594442 PBRM1Q86U86 1689 aa30.76■■■□□ 2.51
ZFP36-202ENST00000594442 GRIN2BQ13224 1484 aa30.74■■■□□ 2.51
ZFP36-202ENST00000594442 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.68■■■□□ 2.5
ZFP36-202ENST00000594442 CHIC1Q5VXU3 224 aa30.64■■■□□ 2.5
ZFP36-202ENST00000594442 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.63■■■□□ 2.49
ZFP36-202ENST00000594442 KIF27Q86VH2 1401 aa30.62■■■□□ 2.49
ZFP36-202ENST00000594442 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.59■■■□□ 2.49
ZFP36-202ENST00000594442 CHD1O14646 1710 aa30.58■■■□□ 2.49
ZFP36-202ENST00000594442 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.52■■■□□ 2.48
ZFP36-202ENST00000594442 FBLN2P98095 1184 aa30.52■■■□□ 2.48
ZFP36-202ENST00000594442 ADAMTS12P58397 1594 aa30.51■■■□□ 2.48
ZFP36-202ENST00000594442 SYNJ2O15056 1496 aa30.51■■■□□ 2.47
ZFP36-202ENST00000594442 IGF1RP08069 1367 aa30.48■■■□□ 2.47
ZFP36-202ENST00000594442 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.46■■■□□ 2.47
ZFP36-202ENST00000594442 OSCARQ8IYS5 282 aa30.45■■■□□ 2.46
ZFP36-202ENST00000594442 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.44■■■□□ 2.46
ZFP36-202ENST00000594442 CUL7Q14999 1698 aa30.38■■■□□ 2.45
ZFP36-202ENST00000594442 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.37■■■□□ 2.45
ZFP36-202ENST00000594442 GRIN2AQ12879 1464 aa30.37■■■□□ 2.45
ZFP36-202ENST00000594442 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa30.29■■■□□ 2.44
ZFP36-202ENST00000594442 CEP170Q5SW79 1584 aa30.23■■■□□ 2.43
ZFP36-202ENST00000594442 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.22■■■□□ 2.43
ZFP36-202ENST00000594442 NUP160Q12769 1436 aa30.21■■■□□ 2.43
ZFP36-202ENST00000594442 EEA1Q15075 1411 aa30.21■■■□□ 2.43
ZFP36-202ENST00000594442 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
ZFP36-202ENST00000594442 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.16■■■□□ 2.42
ZFP36-202ENST00000594442 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa30.16■■■□□ 2.42
ZFP36-202ENST00000594442 PRXQ9BXM0 1461 aa30.14■■■□□ 2.42
ZFP36-202ENST00000594442 ARHGEF11O15085 1522 aa30■■■□□ 2.39
ZFP36-202ENST00000594442 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa29.99■■■□□ 2.39
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