Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BBOF1Q8ND07 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms