Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRPF38BQ5VTL8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRPF38BQ5VTL8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms