Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC18A3Q16572 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC18A3Q16572 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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