Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 SCRN2-208ENST00000581645 1477 ntTSL 517.24■□□□□ 0.353e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.173e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 SCRN2-209ENST00000582459 1624 ntTSL 515.76■□□□□ 0.113e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 MAP3K6-204ENST00000472410 2530 ntTSL 1 (best)17.86■□□□□ 0.451e-6■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.15□□□□□ -1.11e-6■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 ATG2B-203ENST00000473234 550 ntTSL 43.41□□□□□ -1.861e-6■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 FURIN-205ENST00000560824 580 ntTSL 313.72□□□□□ -0.211e-7■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 COPB1-211ENST00000534234 1584 ntTSL 58.14□□□□□ -1.115e-7■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 PPP6R3-208ENST00000525152 582 ntTSL 213.73□□□□□ -0.216e-7■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.032e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.292e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.635e-8■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 UBR4-209ENST00000465036 392 ntTSL 24.42□□□□□ -1.74e-9■■■■■ 37.7
SF3B4Q15427 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.456e-9■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 DEAF1-207ENST00000527170 1623 ntTSL 1 (best)14.22□□□□□ -0.136e-9■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 SND1-214ENST00000489417 1447 ntTSL 218.47■□□□□ 0.556e-14■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 BCAT2-210ENST00000599510 836 ntTSL 218.35■□□□□ 0.537e-12■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 BCAT2-204ENST00000593515 1664 ntTSL 514.42□□□□□ -0.17e-12■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.415e-7■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 RANGAP1-205ENST00000446258 759 ntTSL 312.14□□□□□ -0.475e-7■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 RANGAP1-202ENST00000405486 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.645e-7■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 RANGAP1-207ENST00000455915 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.875e-7■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.395e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.115e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.015e-8■■■■■ 37.6
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SF3B4Q15427 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.425e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 EPHB6-202ENST00000422643 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 EPHB6-201ENST00000411471 3367 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.485e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 EPHB6-209ENST00000616380 4409 ntTSL 211.93□□□□□ -0.55e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 EPHB6-208ENST00000614832 3861 ntTSL 1 (best)11.49□□□□□ -0.575e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TBC1D2B-210ENST00000491479 576 ntTSL 210.16□□□□□ -0.785e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TBC1D2B-212ENST00000497942 312 ntTSL 35.88□□□□□ -1.475e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 PABPC1-220ENST00000522658 736 ntTSL 25.78□□□□□ -1.485e-8■■■■■ 37.6
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SF3B4Q15427 NKTR-217ENST00000498730 4912 ntTSL 24.36□□□□□ -1.713e-14■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 DDX3X-212ENST00000616050 818 ntTSL 510.2□□□□□ -0.782e-18■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 GRK6-204ENST00000502598 557 ntTSL 417.34■□□□□ 0.374e-12■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 ORC2-201ENST00000234296 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.912e-7■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.833e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TRA2A-204ENST00000474586 868 ntTSL 319.3■□□□□ 0.683e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 FAM20C-205ENST00000515795 2177 ntTSL 1 (best)18.59■□□□□ 0.573e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.573e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.493e-11■■■■■ 37.6
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SF3B4Q15427 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.413e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.413e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.293e-11■■■■■ 37.6
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SF3B4Q15427 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 03e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.073e-11■■■■■ 37.6
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SF3B4Q15427 UBE3B-204ENST00000449510 3771 ntTSL 512.26□□□□□ -0.453e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 RAB30-AS1-204ENST00000528156 658 ntTSL 211.88□□□□□ -0.513e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 UBE3B-203ENST00000434735 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.523e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)11.78□□□□□ -0.523e-11■■■■■ 37.6
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SF3B4Q15427 RAB30-AS1-203ENST00000527627 504 ntTSL 310.94□□□□□ -0.663e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 RAB30-AS1-205ENST00000530270 1116 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.693e-11■■■■■ 37.6
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SF3B4Q15427 ACAD11-201ENST00000264990 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.733e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 UBE3B-205ENST00000535900 677 ntTSL 59.66□□□□□ -0.863e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 RAB30-AS1-206ENST00000533528 340 ntTSL 59.39□□□□□ -0.913e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 GLS-214ENST00000495444 394 ntTSL 38.33□□□□□ -1.083e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 TAF1B-205ENST00000434858 1592 ntTSL 27.29□□□□□ -1.243e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 ACAD11-203ENST00000477604 740 ntTSL 36.26□□□□□ -1.413e-11■■■■■ 37.6
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SF3B4Q15427 GLS-207ENST00000417154 837 ntTSL 35.91□□□□□ -1.463e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 ACAD11-208ENST00000496418 3684 ntTSL 25.75□□□□□ -1.493e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 GLS-210ENST00000468352 413 ntTSL 35.4□□□□□ -1.543e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 ACAD11-209ENST00000507705 568 ntTSL 45.08□□□□□ -1.63e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 GLS-209ENST00000461965 575 ntTSL 44.47□□□□□ -1.693e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 ALB-210ENST00000504043 422 ntTSL 24.06□□□□□ -1.763e-11■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.072e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-209ENST00000544949 778 ntTSL 317.22■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-210ENST00000545596 567 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-207ENST00000544200 957 ntTSL 516.05■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-211ENST00000612048 2129 ntTSL 1 (best)15.67■□□□□ 0.12e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-206ENST00000542976 489 ntTSL 514.98□□□□□ -0.012e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-204ENST00000540406 598 ntTSL 414.91□□□□□ -0.022e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-202ENST00000536140 3226 ntTSL 213.79□□□□□ -0.22e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-205ENST00000541956 1102 ntTSL 312.94□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 P3H3-203ENST00000538102 710 ntTSL 312.76□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 PELP1-206ENST00000571170 555 ntTSL 29.9□□□□□ -0.822e-13■■■■■ 37.6
SF3B4Q15427 AMD1-202ENST00000368877 1605 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.081e-6■■■■■ 37.5
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