Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
APOFQ13790 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
APOFQ13790 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOFQ13790 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOFQ13790 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOFQ13790 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOFQ13790 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOFQ13790 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOFQ13790 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
APOFQ13790 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
APOFQ13790 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOFQ13790 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOFQ13790 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOFQ13790 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOFQ13790 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOFQ13790 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
APOFQ13790 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOFQ13790 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
APOFQ13790 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
APOFQ13790 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOFQ13790 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOFQ13790 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
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