Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 PAGE1-201ENST00000376150 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.511e-9■■■■□ 26.3
PABPC4Q13310 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.331e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.432e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.982e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.782e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.732e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.242e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SERPINB6-203ENST00000380524 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SERPINB6-205ENST00000380539 1338 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.662e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SERPINB6-202ENST00000380520 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.112e-9■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.942e-9■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SCFD2-202ENST00000401642 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.444e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 PSMB7-206ENST00000498485 967 ntTSL 517.46■□□□□ 0.396e-13■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 PSMB7-201ENST00000259457 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.466e-13■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 UQCC2-202ENST00000374231 509 ntTSL 317.56■□□□□ 0.48e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.248e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.218e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 REEP6-203ENST00000395484 611 ntTSL 514.1□□□□□ -0.157e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 CENPW-202ENST00000368326 443 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.717e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 CENPW-201ENST00000368325 528 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.827e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.387e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.024e-7■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.174e-6■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 ITM2B-202ENST00000378565 10137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.486e-11■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 ITM2B-203ENST00000463839 810 ntTSL 35.99□□□□□ -1.456e-11■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 UBXN4-208ENST00000490163 3394 ntTSL 24.04□□□□□ -1.764e-6■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-201ENST00000334975 2485 ntTSL 28.43□□□□□ -1.066e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-212ENST00000554294 564 ntTSL 57.4□□□□□ -1.226e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.336e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-220ENST00000555172 1985 ntTSL 24.78□□□□□ -1.646e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.86e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.976e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-208ENST00000459737 4793 ntTSL 1 (best)2.66□□□□□ -1.986e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -26e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-224ENST00000556631 5299 ntTSL 1 (best)1.95□□□□□ -2.16e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.16e-10■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 SSU72-204ENST00000378726 2238 ntTSL 221.57■■□□□ 1.043e-8■■■■□ 26.2
PABPC4Q13310 PSMD9-204ENST00000537407 1195 ntTSL 1 (best)22.82■■□□□ 1.246e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.836e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 PSMD9-209ENST00000543699 1001 ntTSL 519.49■□□□□ 0.716e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 PSMD9-206ENST00000540962 793 ntTSL 218.97■□□□□ 0.636e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.446e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.196e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 PSMD9-203ENST00000535293 1773 ntTSL 314.44□□□□□ -0.16e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 PSMD9-210ENST00000544254 1481 ntTSL 214.35□□□□□ -0.116e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 AC069503.2-202ENST00000544911 1361 ntTSL 212.69□□□□□ -0.386e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 PSMD9-202ENST00000361485 2087 ntTSL 212.58□□□□□ -0.396e-8■■■■□ 26.1
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PABPC4Q13310 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.281e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.251e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.721e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.491e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 26.04□□□□□ -1.445e-25■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 RTEL1-210ENST00000496816 2222 ntTSL 1 (best)21.48■■□□□ 1.034e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.94e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 RTEL1-TNFRSF6B-204ENST00000496281 5314 ntTSL 219.67■□□□□ 0.744e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 5751 ntTSL 218.6■□□□□ 0.574e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.524e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 RTEL1-TNFRSF6B-203ENST00000492259 4824 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.41■□□□□ 0.224e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.214e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.184e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.144e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.571e-323■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 516.38■□□□□ 0.211e-323■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GAPDH-206ENST00000466525 1720 ntTSL 516.2■□□□□ 0.181e-323■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.181e-323■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.181e-323■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.041e-323■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.061e-323■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GAPDH-207ENST00000466588 1363 ntTSL 513.35□□□□□ -0.271e-323■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 GAPDH-211ENST00000619601 1086 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.291e-323■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.426e-10■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.526e-10■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.436e-10■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 HBS1L-216ENST00000533274 2102 ntTSL 27.55□□□□□ -1.26e-10■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.383e-9■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 ANAPC16-203ENST00000478193 734 ntTSL 216.67■□□□□ 0.262e-10■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.986e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.766e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.376e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.316e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.286e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.056e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.116e-8■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 LIG1-214ENST00000597146 589 ntTSL 219.34■□□□□ 0.692e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 LIG1-206ENST00000594067 2697 ntTSL 218.08■□□□□ 0.492e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 LIG1-218ENST00000599322 620 ntTSL 217.05■□□□□ 0.322e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.092e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 LIG1-221ENST00000613670 3949 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 LIG1-207ENST00000594759 4102 ntTSL 1 (best)12.95□□□□□ -0.342e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 LIG1-220ENST00000601091 3957 ntTSL 511.29□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 26.1
PABPC4Q13310 ARL10-204ENST00000514533 258 ntTSL 317.9■□□□□ 0.469e-8■■■■□ 26
PABPC4Q13310 HIGD2A-201ENST00000274787 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.139e-8■■■■□ 26
PABPC4Q13310 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.454e-6■■■■□ 26
PABPC4Q13310 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.164e-6■■■■□ 26
PABPC4Q13310 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.176e-8■■■■□ 26
PABPC4Q13310 MALSU1-203ENST00000476623 479 ntTSL 25.32□□□□□ -1.566e-8■■■■□ 26
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