Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3M2P53677 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3M2P53677 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms