Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF2A1P52655 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GTF2A1P52655 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms