Protein–RNA interactions for Protein: O00571

DDX3X, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 662 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX3XO00571 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.972e-7■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.91e-22■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 AUP1-207ENST00000472800 663 ntTSL 420.6■□□□□ 0.891e-22■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 AUP1-204ENST00000463900 1645 ntTSL 1 (best)18.22■□□□□ 0.511e-22■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 AUP1-202ENST00000425118 1581 ntTSL 1 (best)17.73■□□□□ 0.431e-22■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 AUP1-206ENST00000466894 1658 ntTSL 517.19■□□□□ 0.341e-22■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 LRRC61-204ENST00000471872 653 ntTSL 415.08■□□□□ 05e-21■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 UGDH-208ENST00000510490 534 ntTSL 420.03■□□□□ 0.82e-20■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 UGDH-211ENST00000515021 861 ntTSL 519.06■□□□□ 0.642e-20■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-20■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 UGDH-212ENST00000515398 584 ntTSL 516.38■□□□□ 0.212e-20■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 UGDH-210ENST00000514106 568 ntTSL 416.38■□□□□ 0.212e-20■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 UGDH-209ENST00000510881 549 ntTSL 36.51□□□□□ -1.372e-20■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 UGDH-204ENST00000505698 433 ntTSL 45.91□□□□□ -1.462e-20■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.92e-10■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.62e-10■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC47A1-205ENST00000497548 1900 ntTSL 218.7■□□□□ 0.582e-10■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.342e-10■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC47A1-212ENST00000576095 548 ntTSL 416.03■□□□□ 0.162e-10■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.022e-10■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.122e-10■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC47A1-214ENST00000584348 603 ntTSL 311.32□□□□□ -0.62e-10■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC25A15-204ENST00000478827 1142 ntTSL 524.7■■□□□ 1.541e-6■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.911e-6■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 BOLA3-204ENST00000477685 667 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.21e-65■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.672e-29■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 LRRFIP2-216ENST00000483306 755 ntTSL 418.78■□□□□ 0.62e-29■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 LRRFIP2-218ENST00000490597 1044 ntTSL 218.2■□□□□ 0.52e-29■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.412e-29■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 LRRFIP2-208ENST00000438374 560 ntTSL 416.2■□□□□ 0.182e-29■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-29■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 LRRFIP2-204ENST00000416425 961 ntTSL 313.1□□□□□ -0.312e-29■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 LRRFIP2-213ENST00000461672 563 ntTSL 54.86□□□□□ -1.632e-29■■■■■ 36.5
DDX3XO00571 ACAP3-208ENST00000472541 1946 ntTSL 520.61■□□□□ 0.897e-8■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.797e-8■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ACAP3-211ENST00000479108 485 ntTSL 315.69■□□□□ 0.17e-8■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ACAP3-203ENST00000354980 582 ntTSL 514.56□□□□□ -0.087e-8■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ACAP3-205ENST00000438966 265 ntTSL 37.08□□□□□ -1.287e-8■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.858e-7■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 SHISA5-204ENST00000417962 2306 ntTSL 220.3■□□□□ 0.848e-7■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.157e-10■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.856e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.036e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-209ENST00000555431 1085 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.316e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-210ENST00000555474 1102 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.316e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-205ENST00000554087 1750 ntTSL 512□□□□□ -0.496e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-203ENST00000553687 627 ntTSL 39.14□□□□□ -0.956e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-207ENST00000555012 582 ntTSL 37.98□□□□□ -1.136e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-214ENST00000557244 395 ntTSL 27.58□□□□□ -1.26e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-208ENST00000555335 585 ntTSL 25.84□□□□□ -1.476e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ATP6V1D-213ENST00000556058 551 ntTSL 35.11□□□□□ -1.596e-15■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.153e-8■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.243e-8■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 TEX2-206ENST00000583738 458 ntTSL 312.61□□□□□ -0.392e-10■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 TEX2-208ENST00000584379 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.52e-10■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 TEX2-201ENST00000258991 5232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-10■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ANXA11-208ENST00000463657 780 ntTSL 519.08■□□□□ 0.647e-12■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.417e-12■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ANXA11-205ENST00000438331 6965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.417e-12■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 ANXA11-202ENST00000372231 6720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.467e-12■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.052e-7■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 RFT1-203ENST00000467048 886 ntTSL 317.81■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 RFT1-201ENST00000296292 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.922e-7■■■■■ 36.4
DDX3XO00571 TMEM132A-203ENST00000534983 2477 ntTSL 1 (best)21.39■■□□□ 1.018e-17■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 TMEM132A-214ENST00000544098 3981 ntTSL 1 (best)15.75■□□□□ 0.118e-17■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.813e-11■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 TMEM223-204ENST00000528367 857 ntTSL 218.41■□□□□ 0.543e-11■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.063e-11■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.598e-16■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.568e-16■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.38e-16■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 LINC01287-201ENST00000416982 2624 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.675e-28■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 LINC01287-202ENST00000453187 430 ntTSL 310.88□□□□□ -0.675e-28■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.394e-57■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.384e-57■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 LNPEP-203ENST00000395784 2075 ntTSL 226■■□□□ 1.752e-10■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 COPS8-207ENST00000470452 1005 ntTSL 1 (best)22.9■■□□□ 1.267e-18■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.527e-18■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 COPS8-204ENST00000419015 584 ntTSL 318.33■□□□□ 0.527e-18■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.447e-18■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.487e-18■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.734e-20■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.724e-20■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.144e-20■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 GNE-206ENST00000543356 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.84e-20■■■■■ 36.3
DDX3XO00571 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 17e-14■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 HOMEZ-202ENST00000558278 563 ntTSL 421.78■■□□□ 1.087e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.077e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.784e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.287e-10■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.213e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-213ENST00000456222 558 ntTSL 421.98■■□□□ 1.113e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.633e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-212ENST00000454141 780 ntTSL 318.47■□□□□ 0.553e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-203ENST00000383750 752 ntTSL 317.39■□□□□ 0.373e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-206ENST00000420163 553 ntTSL 417.21■□□□□ 0.353e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-208ENST00000445388 823 ntTSL 515.73■□□□□ 0.113e-11■■■■■ 36.2
DDX3XO00571 SEC22C-204ENST00000416880 527 ntTSL 413.83□□□□□ -0.23e-11■■■■■ 36.2
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