Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KRBOX1C9JBD0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms