Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.731e-8■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.631e-8■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.142e-7■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 ZDHHC6-205ENST00000626395 2906 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.752e-7■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.799e-15■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 RPS23-202ENST00000503605 595 ntTSL 316.83■□□□□ 0.289e-15■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.039e-15■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.199e-15■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 CBLL1-206ENST00000479443 665 ntTSL 413.38□□□□□ -0.272e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC12.16□□□□□ -0.469e-15■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 ARIH2-212ENST00000465217 588 ntTSL 511.99□□□□□ -0.492e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 CBLL1-205ENST00000440859 4432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.642e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 RPS23-203ENST00000504293 576 ntTSL 1 (best)8.71□□□□□ -1.029e-15■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 ZNF496-202ENST00000461277 3857 ntTSL 1 (best)8.32□□□□□ -1.082e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 ETS2-204ENST00000456966 972 ntTSL 37.95□□□□□ -1.142e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 RPS23-208ENST00000512493 443 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.259e-15■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 ARIH2-214ENST00000469038 407 ntTSL 35.37□□□□□ -1.552e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 CBLL1-204ENST00000432748 573 ntTSL 24.98□□□□□ -1.612e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 CBLL1-208ENST00000493361 587 ntTSL 34.43□□□□□ -1.72e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.792e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 CBLL1-207ENST00000487517 560 ntTSL 32.53□□□□□ -22e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.112e-10■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.433e-27■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-27■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.063e-27■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 NAA20-207ENST00000484480 1222 ntTSL 521.35■■□□□ 1.011e-7■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.881e-7■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 NAA20-205ENST00000480550 1000 ntTSL 56.87□□□□□ -1.311e-7■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 NAA20-204ENST00000463154 1036 ntTSL 36.67□□□□□ -1.341e-7■■■■■ 30.1
RBM22Q9NW64 ADGRV1-218ENST00000639473 6608 ntTSL 56.44□□□□□ -1.384e-7■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 ADGRV1-232ENST00000640403 6723 ntTSL 53.9□□□□□ -1.794e-7■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.18e-8■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 LRP5-206ENST00000529993 5103 ntTSL 1 (best)15.41■□□□□ 0.068e-8■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.612e-10■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 KRT8-213ENST00000550170 2202 ntTSL 518.08■□□□□ 0.492e-10■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-10■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 KRT8-208ENST00000547031 883 ntTSL 216.32■□□□□ 0.22e-10■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.112e-10■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 KRT8-203ENST00000546583 2862 ntTSL 514.88□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 MVD-202ENST00000561895 499 ntTSL 213.05□□□□□ -0.325e-12■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 SLC38A2-201ENST00000256689 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.919e-9■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 SLC38A2-208ENST00000549258 4384 ntTSL 23.51□□□□□ -1.859e-9■■■■■ 30
RBM22Q9NW64 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ATP13A1-208ENST00000474955 927 ntTSL 514.04□□□□□ -0.163e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ATP13A1-211ENST00000492774 482 ntTSL 411.82□□□□□ -0.523e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ATP13A1-201ENST00000291503 3483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ATP13A1-203ENST00000455627 554 ntTSL 411.06□□□□□ -0.643e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.725e-17■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.095e-17■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EEF1A1-201ENST00000309268 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.65e-17■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.555e-17■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.695e-17■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.016e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 FAM3C-203ENST00000426156 662 ntTSL 527.15■■□□□ 1.944e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.463e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 PPP2R2A-218ENST00000522535 653 ntTSL 423.06■■□□□ 1.284e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.224e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-213ENST00000508684 3059 ntTSL 221.25■□□□□ 0.994e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 GART-208ENST00000430874 1036 ntTSL 520.81■□□□□ 0.924e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.885e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-218ENST00000583637 758 ntTSL 319.37■□□□□ 0.695e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-202ENST00000578532 684 ntTSL 219.37■□□□□ 0.695e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.621e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.511e-9■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.511e-9■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.474e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.394e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NUP88-210ENST00000574867 2081 ntTSL 217.35■□□□□ 0.374e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.361e-6■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NUP160-207ENST00000528501 1961 ntTSL 217.04■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-209ENST00000580387 827 ntTSL 517.01■□□□□ 0.315e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-221ENST00000615760 650 ntTSL 316.95■□□□□ 0.35e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPL17-223ENST00000618613 856 ntAPPRIS P1 TSL 316.81■□□□□ 0.285e-10■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.284e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDX17-203ENST00000403230 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)16.58■□□□□ 0.241e-9■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EIF4A1-207ENST00000578324 1577 ntTSL 516.38■□□□□ 0.211e-11■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 FAM3C-202ENST00000412653 561 ntTSL 416.33■□□□□ 0.24e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.114e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 RPRD1B-203ENST00000462548 2436 ntTSL 515.32■□□□□ 0.044e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.044e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 01e-9■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 EIF4A1-228ENST00000583389 951 ntTSL 314.77□□□□□ -0.051e-11■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 POLR2A-203ENST00000574158 461 ntTSL 214.05□□□□□ -0.164e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.174e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 ADD1-207ENST00000446856 3745 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.184e-8■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 PPP2R2A-211ENST00000520329 836 ntTSL 513.83□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 PPP2R2A-206ENST00000518254 755 ntTSL 513.83□□□□□ -0.24e-7■■■■■ 29.9
RBM22Q9NW64 PPP2R2A-223ENST00000524169 784 ntTSL 313.51□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 29.9
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