Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
FAM47EQ6ZV65 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FAM47EQ6ZV65 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms