Protein–RNA interactions for Protein: Q16629

SRSF7, Serine/arginine-rich splicing factor 7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF7Q16629 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.273e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-201ENST00000322910 2352 ntTSL 215.73■□□□□ 0.113e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.043e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-237ENST00000583858 1015 ntTSL 515.01□□□□□ -0.013e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 ACADVL-216ENST00000578824 720 ntTSL 28.12□□□□□ -1.113e-6■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 SF3A3-201ENST00000373019 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.131e-11■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 SF3A3-202ENST00000460925 793 ntTSL 24.2□□□□□ -1.741e-11■□□□□ 8.3
SRSF7Q16629 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 PLK1-202ENST00000562272 4135 ntTSL 29.98□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 ACADVL-225ENST00000581378 752 ntTSL 313.67□□□□□ -0.225e-12■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 ACADVL-230ENST00000582379 833 ntTSL 37.57□□□□□ -1.25e-12■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SMARCC1-203ENST00000454240 636 ntTSL 322.55■■□□□ 1.23e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.053e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 PLK1-205ENST00000564794 683 ntTSL 513.34□□□□□ -0.273e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 EIF3D-201ENST00000216190 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.783e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 EIF3D-209ENST00000462641 887 ntTSL 28.53□□□□□ -1.043e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 EIF3D-203ENST00000405442 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.143e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SMARCC1-202ENST00000425518 3827 ntTSL 26.39□□□□□ -1.393e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 EIF3D-211ENST00000478547 452 ntTSL 36.14□□□□□ -1.433e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 NECAB3-220ENST00000606699 1022 ntTSL 214.37□□□□□ -0.112e-9■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-213ENST00000529285 550 ntTSL 516.68■□□□□ 0.269e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 HNRNPH1-210ENST00000504549 980 ntTSL 513.69□□□□□ -0.229e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 HNRNPH1-231ENST00000519033 832 ntTSL 313.69□□□□□ -0.229e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 PIP4K2A-205ENST00000474335 559 ntTSL 213.43□□□□□ -0.262e-7■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.312e-7■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 HNRNPH1-205ENST00000502632 1509 ntTSL 212.86□□□□□ -0.359e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-206ENST00000526248 771 ntTSL 512.31□□□□□ -0.449e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-220ENST00000534555 387 ntTSL 312.29□□□□□ -0.449e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.59e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-212ENST00000529173 1373 ntTSL 511.43□□□□□ -0.589e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.589e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.679e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-209ENST00000527446 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.749e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SON-208ENST00000455528 8394 ntTSL 1 (best)10.3□□□□□ -0.769e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-217ENST00000531188 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.779e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SON-201ENST00000300278 7477 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.89e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-216ENST00000530721 796 ntTSL 39.87□□□□□ -0.839e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-218ENST00000532872 737 ntTSL 39.87□□□□□ -0.839e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 HNRNPH1-247ENST00000523921 584 ntTSL 29.27□□□□□ -0.939e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SON-202ENST00000356577 8813 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.939e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 HNRNPH1-206ENST00000502904 2913 ntTSL 28.93□□□□□ -0.989e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-202ENST00000422465 903 ntTSL 28.91□□□□□ -0.989e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-208ENST00000527273 390 ntTSL 38.9□□□□□ -0.989e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 HNRNPH1-239ENST00000521173 831 ntTSL 58.77□□□□□ -1.019e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS27A-202ENST00000402285 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.68□□□□□ -1.022e-7■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 38.35□□□□□ -1.079e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 38.35□□□□□ -1.079e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.079e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.19e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 58.06□□□□□ -1.129e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS27A-203ENST00000404735 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.132e-7■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 57.99□□□□□ -1.139e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 57.84□□□□□ -1.159e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.169e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS27A-210ENST00000495843 1159 ntTSL 57.23□□□□□ -1.252e-7■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.39e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SETD5-215ENST00000464410 593 ntTSL 45.49□□□□□ -1.539e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 HNRNPH1-227ENST00000515481 5564 ntTSL 25.08□□□□□ -1.69e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 METAP2-208ENST00000549808 538 ntTSL 44.9□□□□□ -1.631e-7■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 METAP2-204ENST00000546478 232 ntTSL 24.73□□□□□ -1.651e-7■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.759e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 SETD5-229ENST00000497213 552 ntTSL 43.53□□□□□ -1.849e-6■□□□□ 8.2
SRSF7Q16629 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.235e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 TRNP1-202ENST00000531285 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.51■□□□□ 0.235e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 04e-13■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.014e-13■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CYP2W1-203ENST00000415893 890 ntTSL 314.21□□□□□ -0.134e-13■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.145e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CYP2W1-205ENST00000468456 557 ntTSL 413.89□□□□□ -0.194e-13■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CYP2W1-204ENST00000462453 566 ntTSL 412.91□□□□□ -0.344e-13■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.45e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 BRD2-212ENST00000482914 4834 ntTSL 1 (best)11.61□□□□□ -0.555e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 BRD2-204ENST00000449025 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)10.18□□□□□ -0.785e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 BRD2-205ENST00000449085 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.785e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 BRD2-208ENST00000464592 1590 ntTSL 58.52□□□□□ -1.055e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 BRD2-203ENST00000395287 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.095e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 RBM39-209ENST00000416529 594 ntTSL 36.39□□□□□ -1.395e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 RBM39-234ENST00000487604 370 ntTSL 34.73□□□□□ -1.655e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 BRD2-207ENST00000463639 946 ntTSL 24.56□□□□□ -1.685e-7■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.428e-34■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.048e-34■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.398e-34■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.628e-34■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-215ENST00000570125 681 ntTSL 422.36■■□□□ 1.179e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 EHBP1-204ENST00000405482 1311 ntTSL 217.69■□□□□ 0.429e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-206ENST00000563815 1913 ntTSL 216.66■□□□□ 0.269e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.089e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.139e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.259e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.349e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.469e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.539e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.579e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-212ENST00000568968 461 ntTSL 211.14□□□□□ -0.639e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.639e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.659e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.659e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 310.83□□□□□ -0.689e-6■□□□□ 8.1
SRSF7Q16629 CARHSP1-211ENST00000568117 521 ntTSL 310.81□□□□□ -0.689e-6■□□□□ 8.1
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