Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFR3A-206ENST00000522709 780 ntTSL 516.95■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX41-207ENST00000507900 1564 ntTSL 516.94■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.33e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.292e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CHTF18-206ENST00000461268 814 ntTSL 516.89■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEXIM2-203ENST00000586681 783 ntTSL 216.85■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEXIM2-208ENST00000593138 581 ntTSL 316.84■□□□□ 0.293e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SLC2A6-205ENST00000485978 3417 ntTSL 516.83■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EXOC2-202ENST00000443083 720 ntTSL 316.82■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SUCLA2-202ENST00000433022 467 ntTSL 516.8■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SMUG1-218ENST00000511522 561 ntTSL 316.79■□□□□ 0.283e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LINC00910-205ENST00000592094 1042 ntTSL 1 (best)16.76■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NOMO2-206ENST00000564991 3765 ntTSL 516.76■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RUFY1-207ENST00000502984 658 ntTSL 316.69■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HDAC6-235ENST00000495515 569 ntTSL 316.67■□□□□ 0.267e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RRP12-210ENST00000491313 1919 ntTSL 216.64■□□□□ 0.263e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SF3B2-211ENST00000531041 1440 ntTSL 1 (best)16.63■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C19orf70-205ENST00000590075 773 ntTSL 216.62■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-212ENST00000557478 595 ntTSL 516.46■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PKD1P5-203ENST00000542593 761 ntTSL 516.46■□□□□ 0.233e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LAD1-206ENST00000631576 550 ntTSL 416.44■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CLK3-227ENST00000570296 916 ntTSL 516.43■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC138969.1-204ENST00000537085 543 ntTSL 316.34■□□□□ 0.213e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP50-218ENST00000493456 478 ntTSL 316.32■□□□□ 0.22e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELAC2-209ENST00000487229 2452 ntTSL 216.28■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.23e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MYH10-204ENST00000411957 732 ntTSL 316.26■□□□□ 0.192e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 SSR4-206ENST00000460616 2482 ntTSL 216.25■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CLTCL1-203ENST00000449918 582 ntTSL 316.23■□□□□ 0.193e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEXIM2-204ENST00000589230 796 ntTSL 216.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CLK3-207ENST00000562389 572 ntTSL 416.16■□□□□ 0.183e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CASP9-204ENST00000400777 1878 ntTSL 1 (best)16.16■□□□□ 0.182e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RNF40-206ENST00000564260 768 ntTSL 216.13■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-221ENST00000532639 748 ntTSL 516.12■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-218ENST00000530994 5945 ntTSL 216.12■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.173e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ACAD8-215ENST00000533387 3197 ntTSL 216.04■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ARMC6-219ENST00000545091 1079 ntTSL 516.02■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 WDR81-210ENST00000474958 561 ntTSL 516.01■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-214ENST00000528594 5787 ntTSL 216■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DNAJC8-205ENST00000489277 1600 ntTSL 1 (best)15.98■□□□□ 0.151e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C19orf70-202ENST00000585605 586 ntTSL 315.98■□□□□ 0.153e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.142e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.143e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KLC2-209ENST00000461611 643 ntTSL 315.86■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ATP13A2-207ENST00000502860 687 ntTSL 1 (best)15.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RPL22-203ENST00000465335 806 ntTSL 315.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NEDD1-210ENST00000557400 604 ntTSL 515.85■□□□□ 0.133e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CASP9-211ENST00000546969 569 ntTSL 215.85■□□□□ 0.132e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 RRP12-205ENST00000465394 652 ntTSL 515.77■□□□□ 0.123e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.119e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GUK1-224ENST00000480056 544 ntTSL 315.72■□□□□ 0.113e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CTBP1-202ENST00000382950 547 ntTSL 215.69■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.13e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 KRT19-203ENST00000462611 504 ntTSL 215.6■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 WRAP73-207ENST00000471223 6089 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.093e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ELOVL1-206ENST00000470769 1215 ntTSL 215.56■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUMA1-217ENST00000540626 2276 ntTSL 215.56■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 DRG2-207ENST00000497744 964 ntTSL 215.55■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 AGER-212ENST00000484849 1597 ntTSL 1 (best)15.54■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.085e-8■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.083e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MFSD10-208ENST00000509676 1178 ntTSL 515.45■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PXMP2-202ENST00000428960 762 ntTSL 315.44■□□□□ 0.062e-11■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.057e-7■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.051e-6■■■■■ 41.9
EFTUD2Q15029 MBD6-213ENST00000552255 509 ntTSL 415.37■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 41.9
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