Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
ODF1Q14990 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ODF1Q14990 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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