Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 FTH1-211ENST00000534719 788 ntTSL 1 (best)15.07■□□□□ 08e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 HSPG2-211ENST00000486901 3586 ntTSL 214.95□□□□□ -0.028e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 SRC-204ENST00000373578 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.028e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 FTH1-210ENST00000534180 983 ntTSL 214.8□□□□□ -0.048e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 SRC-207ENST00000477066 3300 ntTSL 214.77□□□□□ -0.048e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 NPC1-202ENST00000540608 2790 ntTSL 214.69□□□□□ -0.068e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 CDC25B-201ENST00000245960 3597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.068e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 PRPF8-214ENST00000576585 2157 ntTSL 214.29□□□□□ -0.128e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 SRC-203ENST00000373567 4321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.178e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 FTH1-208ENST00000532829 912 ntTSL 213.93□□□□□ -0.188e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 FTH1-205ENST00000529631 507 ntTSL 4 BASIC13.86□□□□□ -0.198e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 SRC-201ENST00000358208 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.318e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 PRPF8-212ENST00000575116 460 ntTSL 312.98□□□□□ -0.338e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 CFL1-207ENST00000527752 766 ntTSL 512.72□□□□□ -0.373e-28■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 FTH1-209ENST00000533138 885 ntTSL 512.44□□□□□ -0.428e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 FTH1-203ENST00000529191 530 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.438e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 G6PC-202ENST00000585489 1097 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.538e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 FTH1-204ENST00000529548 567 ntTSL 311.1□□□□□ -0.638e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 NPC1-210ENST00000591051 3171 ntTSL 210.98□□□□□ -0.658e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 G6PC-204ENST00000592383 987 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.88e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 FTH1-207ENST00000532601 742 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.878e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.98e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 NPC1-204ENST00000586718 574 ntTSL 39.31□□□□□ -0.928e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 FTH1-212ENST00000620041 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.958e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 G6PC-203ENST00000588481 604 ntTSL 28.6□□□□□ -1.038e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 KIAA0907-207ENST00000478002 1065 ntTSL 57.18□□□□□ -1.261e-323■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.87□□□□□ -1.951e-323■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 228.94■■■□□ 2.222e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 CAPN15-207ENST00000568988 911 ntTSL 328.94■■■□□ 2.222e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.792e-6■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 LDHA-220ENST00000542179 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.812e-8■■□□□ 11.9
NOLC1Q14978 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.923e-9■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 SRSF2-206ENST00000582449 1518 ntTSL 220.24■□□□□ 0.833e-9■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.483e-9■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 SRSF2-204ENST00000452355 1357 ntTSL 517.43■□□□□ 0.383e-9■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 SRSF2-208ENST00000585202 1359 ntTSL 316.26■□□□□ 0.193e-9■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 SRSF2-210ENST00000589919 595 ntTSL 26.91□□□□□ -1.33e-9■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 SRSF2-209ENST00000586778 1001 ntTSL 25.84□□□□□ -1.473e-9■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 FAM118A-212ENST00000479180 649 ntTSL 515.42■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 FAM118A-208ENST00000462361 712 ntTSL 213.18□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 PPP1CB-201ENST00000296122 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 RRM1-210ENST00000532170 3166 ntTSL 27.96□□□□□ -1.132e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 RRM1-212ENST00000533349 2863 ntTSL 27.22□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.342e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 RRM1-213ENST00000533495 2381 ntTSL 25.92□□□□□ -1.462e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 SPDYA-205ENST00000462832 2081 ntTSL 24.94□□□□□ -1.622e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 AHSG-203ENST00000478441 1269 ntTSL 214.39□□□□□ -0.111e-323■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.394e-8■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 VPS35-210ENST00000568784 4017 ntTSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.374e-8■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.324e-8■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.311e-10■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-10■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 PABPC1-213ENST00000519848 676 ntTSL 29.45□□□□□ -0.93e-13■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 UQCRB-208ENST00000521948 997 ntTSL 28.54□□□□□ -1.041e-10■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 UQCRB-205ENST00000518876 3968 ntTSL 1 (best)8.17□□□□□ -1.11e-10■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ILF2-204ENST00000480213 1008 ntTSL 57.98□□□□□ -1.134e-8■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.214e-8■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 PABPC1-216ENST00000520868 971 ntTSL 57.11□□□□□ -1.273e-13■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 PABPC1-220ENST00000522658 736 ntTSL 26.77□□□□□ -1.333e-13■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 PABPC1-204ENST00000517990 487 ntTSL 56.72□□□□□ -1.333e-13■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 UQCRB-203ENST00000517603 1041 ntTSL 1 (best)6.49□□□□□ -1.371e-10■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.371e-10■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 UQCRB-207ENST00000521036 982 ntTSL 26.35□□□□□ -1.391e-10■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.821e-10■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ATP1A1-202ENST00000369494 698 ntTSL 39.91□□□□□ -0.821e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 APP-210ENST00000448850 1846 ntTSL 1 (best)15.89■□□□□ 0.136e-7■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ERBB3-217ENST00000551085 4382 ntTSL 214.01□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.673e-7■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.33e-7■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.093e-7■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 LSS-210ENST00000491729 2143 ntTSL 215.26■□□□□ 0.033e-7■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 LSS-208ENST00000474319 3601 ntTSL 212.83□□□□□ -0.363e-7■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 LSS-203ENST00000419093 517 ntTSL 310.79□□□□□ -0.683e-7■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.121e-7■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.115e-13■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.035e-13■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ANKRD10-209ENST00000489973 745 ntTSL 39.74□□□□□ -0.855e-13■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 RPL23-209ENST00000584056 549 ntTSL 211.95□□□□□ -0.58e-10■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 TFRC-215ENST00000491658 396 ntTSL 55.37□□□□□ -1.554e-26■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 NAMPT-201ENST00000222553 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-8■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 AFP-204ENST00000508838 728 ntTSL 25.98□□□□□ -1.457e-43■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.53e-7■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ERBB3-219ENST00000551242 2755 ntTSL 1 (best)14.94□□□□□ -0.021e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ERBB3-201ENST00000267101 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.561e-6■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 UBC-204ENST00000536661 624 ntTSL 216.37■□□□□ 0.214e-29■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 UBC-211ENST00000542416 517 ntTSL 49.74□□□□□ -0.854e-29■■□□□ 11.8
NOLC1Q14978 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.118e-8■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 CCDC144NL-AS1-205ENST00000439794 481 ntTSL 315.74■□□□□ 0.118e-8■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 CCDC144NL-AS1-218ENST00000583962 3352 ntTSL 1 (best)13.4□□□□□ -0.268e-8■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 CCDC144NL-AS1-207ENST00000577537 3727 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.328e-8■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 CCDC144NL-AS1-215ENST00000582324 756 ntTSL 311.85□□□□□ -0.518e-8■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 CCDC144NL-AS1-201ENST00000417232 709 ntTSL 36.31□□□□□ -1.48e-8■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 OAZ1-204ENST00000588673 780 ntTSL 322.4■■□□□ 1.186e-9■■□□□ 11.7
NOLC1Q14978 FN1-218ENST00000473614 568 ntTSL 27.8□□□□□ -1.162e-55■■□□□ 11.7
Retrieved 100 of 7,921 protein–RNA pairs in 56 ms