Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PGGT1BP53609 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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PGGT1BP53609 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PGGT1BP53609 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PGGT1BP53609 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PGGT1BP53609 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
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PGGT1BP53609 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PGGT1BP53609 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
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PGGT1BP53609 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PGGT1BP53609 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
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