Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
RPL35P42766 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RPL35P42766 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RPL35P42766 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms