Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PCK1P35558 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCK1P35558 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCK1P35558 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCK1P35558 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PCK1P35558 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCK1P35558 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCK1P35558 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCK1P35558 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCK1P35558 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCK1P35558 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCK1P35558 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCK1P35558 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCK1P35558 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms