Protein–RNA interactions for Protein: O15197

EPHB6, Ephrin type-B receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB6O15197 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EPHB6O15197 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EPHB6O15197 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms