Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J6

KCNE2, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE2Q9Y6J6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KCNE2Q9Y6J6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KCNE2Q9Y6J6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KCNE2Q9Y6J6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KCNE2Q9Y6J6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
KCNE2Q9Y6J6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
KCNE2Q9Y6J6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KCNE2Q9Y6J6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNE2Q9Y6J6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNE2Q9Y6J6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KCNE2Q9Y6J6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KCNE2Q9Y6J6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms