Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R2

MMP24, Matrix metalloproteinase-24, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP24Q9Y5R2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MMP24Q9Y5R2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP24Q9Y5R2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MMP24Q9Y5R2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP24Q9Y5R2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MMP24Q9Y5R2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MMP24Q9Y5R2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MMP24Q9Y5R2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MMP24Q9Y5R2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MMP24Q9Y5R2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MMP24Q9Y5R2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms