Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGB5Q9Y5G0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCDHGB5Q9Y5G0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCDHGB5Q9Y5G0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHGB5Q9Y5G0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHGB5Q9Y5G0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHGB5Q9Y5G0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGB5Q9Y5G0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms