Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPB41L3Q9Y2J2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPB41L3Q9Y2J2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EPB41L3Q9Y2J2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EPB41L3Q9Y2J2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
EPB41L3Q9Y2J2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EPB41L3Q9Y2J2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EPB41L3Q9Y2J2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms