Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
BTRCQ9Y297 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
BTRCQ9Y297 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
BTRCQ9Y297 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BTRCQ9Y297 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
BTRCQ9Y297 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
BTRCQ9Y297 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
BTRCQ9Y297 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms