Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMG5Q9UPR3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMG5Q9UPR3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMG5Q9UPR3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SMG5Q9UPR3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SMG5Q9UPR3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SMG5Q9UPR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SMG5Q9UPR3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms