Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN70

PCDHGC3, Protocadherin gamma-C3, humanhuman

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGC3Q9UN70 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHGC3Q9UN70 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHGC3Q9UN70 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHGC3Q9UN70 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHGC3Q9UN70 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHGC3Q9UN70 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHGC3Q9UN70 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHGC3Q9UN70 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHGC3Q9UN70 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCDHGC3Q9UN70 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHGC3Q9UN70 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHGC3Q9UN70 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHGC3Q9UN70 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHGC3Q9UN70 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGC3Q9UN70 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGC3Q9UN70 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGC3Q9UN70 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHGC3Q9UN70 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHGC3Q9UN70 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms