Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
SYNRGQ9UMZ2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SYNRGQ9UMZ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.66■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
SYNRGQ9UMZ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
SYNRGQ9UMZ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
SYNRGQ9UMZ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNRGQ9UMZ2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNRGQ9UMZ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNRGQ9UMZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
SYNRGQ9UMZ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SYNRGQ9UMZ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNRGQ9UMZ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
SYNRGQ9UMZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
SYNRGQ9UMZ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
SYNRGQ9UMZ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNRGQ9UMZ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SYNRGQ9UMZ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
SYNRGQ9UMZ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNRGQ9UMZ2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SYNRGQ9UMZ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SYNRGQ9UMZ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
SYNRGQ9UMZ2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
SYNRGQ9UMZ2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms