Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM07

PADI4, Protein-arginine deiminase type-4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI4Q9UM07 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PADI4Q9UM07 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PADI4Q9UM07 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PADI4Q9UM07 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PADI4Q9UM07 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PADI4Q9UM07 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PADI4Q9UM07 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PADI4Q9UM07 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms