Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CBLCQ9ULV8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CBLCQ9ULV8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CBLCQ9ULV8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBLCQ9ULV8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CBLCQ9ULV8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CBLCQ9ULV8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms