Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
GTF3C4Q9UKN8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GTF3C4Q9UKN8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GTF3C4Q9UKN8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C4Q9UKN8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
GTF3C4Q9UKN8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C4Q9UKN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C4Q9UKN8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GTF3C4Q9UKN8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
GTF3C4Q9UKN8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GTF3C4Q9UKN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF3C4Q9UKN8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF3C4Q9UKN8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GTF3C4Q9UKN8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GTF3C4Q9UKN8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms