Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPUSD1Q9UJJ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPUSD1Q9UJJ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPUSD1Q9UJJ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPUSD1Q9UJJ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms