Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SMPXQ9UHP9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SMPXQ9UHP9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SMPXQ9UHP9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMPXQ9UHP9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMPXQ9UHP9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMPXQ9UHP9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms